Interactive Molecular Dynamics - Virtual & augmented ENvIronments for Simulation & Experiments
Book Sections Year : 2024

Interactive Molecular Dynamics

Dynamique Moléculaire Interactive

Abstract

Interactive Molecular Dynamics (IMD) is a real-time simulation technique that allows scientists to interact with virtual molecular systems. Users can observe a simulation in progress in real time and manipulate the motion of individual atoms and molecules by applying forces, and receive feedback on the dynamic response of these systems in interactive time. The development of IMD has been influenced by technological and algorithmic advances in simulation tools as well as advances in human-computer interaction, including haptic devices or augmented and virtual reality approaches, and increasingly affordable devices. Scientific and practical applications include mechanobiology research, determination of experimental structures, and nanoscale property visualization for dissemination. IMD has made significant advances in performance, visualization, and data analysis.
La dynamique moléculaire interactive (IMD) est une technique de simulation en temps réel qui permet aux scientifiques d'interagir avec des systèmes moléculaires virtuels. Les utilisateurs peuvent observer une simulation en cours en temps réel et manipuler le mouvement d'atomes et de molécules individuels en appliquant des forces, et recevoir des retours sur la réponse dynamique de ces systèmes en temps interactif. Le développement de l'IMD a été influencé par les avancées technologiques et algorithmiques dans les outils de simulation ainsi que par les avancées dans l'interaction homme-machine, y compris les dispositifs haptiques ou les approches de réalité augmentée et virtuelle, des appareils de plus en plus abordables. Les applications scientifiques et pratiques comprennent la recherche en mécanobiologie, la détermination des structures expérimentales et la visualisation des propriétés à l'échelle nanométrique pour la diffusion. IMD a fait des progrès significatifs dans la performance, la visualisation et l'analyse des données.
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Dates and versions

hal-04307111 , version 1 (25-11-2023)

Identifiers

Cite

André Lanrezac, Nicolas Férey, Marc Baaden. Interactive Molecular Dynamics. Comprehensive Computational Chemistry, 3, Elsevier, pp.454-474, 2024, ⟨10.1016/B978-0-12-821978-2.00115-X⟩. ⟨hal-04307111⟩
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